Inhaltspezifische Aktionen

RESET

Forschungsverbund RESET - ESBL- und (Fluor)chinolon-Resistenz bei Enterobakterien

 

Der aus 10 Partnern bestehende Forschungsverbund RESET wird von der Stiftung Tierärztliche Hochschule Hannover koordiniert und vom Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF) gefördert. Der Verbund befasst sich mit der Erforschung von Resistenzen gegen Antibiotika bei Enterobakterien, zu denen Darmbakterien von Mensch und Tier, aber auch in der Umwelt vorkommende Bakterien zählen. Das von unserer Arbeitsgruppe am Institut für Med. Mikrobiologie durchgeführte RESET-Arbeitspaket untersucht die Häufigkeit des Auftretens und den genetischen Verwandtschaftsgrad ESBL/AmpC/Carbapenemase-produzierender und Fluorchinolon-resistenter Enterobakterien, die gegen die wichtigen Antibiotika-Klassen β-Laktam-Antibiotika und Fluorchinolone resistent sind. Die Charakterisierung der Bakterienisolate erfolgt im Projekt mittels Gesamtgenomsequenzierung (Next-Generation Sequencing). Die gewonnenen Daten dienen auch der Untersuchung epidemiologischer Fragestellungen und der Klassifizierung von Plasmiden, die die Hauptursache für die Verbreitung von Resistenzgenen in Bakterien darstellen.

 

Weitere Informationen

 

www.reset-verbund.de/

 

Laufzeit

 

01.11.2010 bis 30.04.2017 (RESET I+II inkl. Laufzeitverlängerung)

 

Verbundpartner

 

  • Stiftung Tierärztliche Hochschule Hannover (Koordinator)
  • Bundesinstitut für Risikobewertung Berlin
  • Freie Universität Berlin
  • Friedrich-Loeffler-Institut, Neustadt-Mariensee
  • Justus-Liebig-Universität Gießen
  • Robert-Koch-Institut Wernigerode
  • Charité - Universitätsmedizin Berlin

 

Am Institut für Med. Mikrobiologie durchgeführtes RESET II-Teilprojekt


IP9: Genombasierte Epidemiologie von ESBL-, AmpC- oder Carbapenemase-produzierenden gram-negativen Bakterien aus humanen, Veterinär- und Umweltproben


Beteiligte Institutsmitarbeiter


  • Prof. Dr. Trinad Chakraborty
  • Dr. Can Imirzalioglu
  • Dr. Linda Falgenhauer
  • Dr. Swapnil Doijad
  • Christina Gerstmann
  • Natalia Lest


Publikationen


Erste Förderphase:

  1. Falgenhauer, L., Yao, Y., Fritzenwanker, M., Schmiedel, J., Imirzalioglu, C., Chakraborty, T. 2014 Complete genome sequence of Phage-like plasmid pECOH89 encoding CTX-M-15. Genome A. 2:e00356-14
  2. Künne, C., Billion, A., Mshana, S.E., Schmiedel, J., Witte, W., Domann, E., Hossain, H., Hain, T., Imirzalioglu, C., Chakraborty, T. 2012. The complete sequence of plasmids of Escherichia coli HUSEC41.J Bacteriol. 194:532-533
  3. Mshana, S.E., Gerwing, L., Minde, M., Hain, T., Domann, E., Lyamuya, E., Chakraborty, T., Imirzalioglu, C. 2011. Outbreak of a novel Enterobacter sp. carrying blaCTX-M-15 in a neonatal unit of a tertiary care hospital in Tanzania. Int J Antimicrob Agents. 38:265-269.
  4. Mshana, S.E., Hain, T., Domann, E., Lyamuya, E.F., Chakraborty, T., Imirzalioglu, C. 2013. Predominance of Klebsiella pneumoniae ST14 carrying CTX-M-15 causing neonatal sepsis in Tanzania. BMC Infect Dis. 13:466.
  5. Mshana, S.E., Imirzalioglu, C., Hain, T., Domann, E., Lyamuya, F., Chakraborty, T. 2011. Multiple ST clonal complexes, with a predominance of ST131, of Escherichia coli harbouring blaCTX-M-15 in a tertiary hospital in Tanzania. Clin Microbiol Infect.17:1279-1282.

 

Zweite Förderphase:

  1. Doijad S, Imirzalioglu C, Yao Y, Pati NB, Falgenhauer L, Hain T, Foesel BU, Abt B, Overmann J, Mirambo MM, Mshana SE, Chakraborty T. 2016. Enterobacter bugandensis sp. nov., isolated from neonatal blood. Int J Syst Evol Microbiol 66.
  2. Falgenhauer L, Ghosh H, Guerra B, Yao Y, Fritzenwanker M, Fischer J, Helmuth R, Imirzalioglu C, Chakraborty T. 2015. Comparative genome analysis of IncHI2 VIM-1 carbapenemase-encoding plasmids of Escherichia coli and Salmonella enterica isolated from a livestock farm in Germany. Vet Microbiol 200:114–117.
  3. Falgenhauer L, Imirzalioglu C, Ghosh H, Gwozdzinski K, Schmiedel J, Gentil K, Bauerfeind R, Kämpfer P, Seifert H, Michael GB, Schwarz S, Pfeifer Y, Werner G, Pietsch M, Roesler U, Guerra B, Fischer J, Sharp H, Käsbohrer A, Goesmann A, Hille K, Kreienbrock L, Chakraborty T. 2016. Circulation of clonal populations of fluoroquinolone-resistant CTX-M-15-producing Escherichia coli ST410 in humans and animals in Germany. Int J Antimicrob Agents 47:457–465.
  4. Falgenhauer L, Schmiedel J, Ghosh H, Fritzenwanker M, Yao Y, Bauerfeind R, Imirzalioglu C, Chakraborty T. 2014. Resistance plasmids in ESBL-encoding Escherichia coli isolates from humans, dogs and cats. Berl Munch Tierarztl Wochenschr 12:458–463.
  5. Falgenhauer L, Waezsada S-E, Gwozdzinski K, Ghosh H, Doijad S, Bunk B, Spröer C, Imirzalioglu C, Seifert H, Irrgang A, Fischer J, Guerra B, Käsbohrer A, Overmann J, Goesmann A, Chakraborty T. 2016. Chromosomal locations of mcr-1 and blaCTX-M-15 in fluoroquinolone-resistant Escherichia coli ST410. Emerg Infect Dis 22:1689–1691.
  6. Falgenhauer L, Waezsada S-E, Yao Y, Imirzalioglu C, Käsbohrer A, Roesler U, Michael GB, Schwarz S, Werner G, Kreienbrock L, Chakraborty T. 2016. Colistin resistance gene mcr-1 in extended-spectrum β-lactamase-producing and carbapenemase-producing Gram-negative bacteria in Germany. Lancet Infect Dis 16:282–283.
  7. Falgenhauer L, Yao Y, Fritzenwanker M, Schmiedel J, Imirzalioglu C, Chakraborty T. 2014. Complete genome sequence of phage-like plasmid pECOH89, encoding CTX-M-15. Genome Announc 2:e00356-14.
  8. Ghosh H, Doijad S, Bunk B, Falgenhauer L, Yao Y, Spröer C, Gentil K, Schmiedel J, Imirzalioglu C, Overmann J, Chakraborty T. 2016. Detection of translocatable units in a blaCTX-M-15 extended-spectrum β-lactamase-producing ST131 Escherichia coli isolate using a hybrid sequencing approach. Int J Antimicrob Agents 47:245–247.
  9. Guenther S, Falgenhauer L, Semmler T, Imirzalioglu C, Chakraborty T, Roesler U, Roschanski N. 2017. Environmental emission of multiresistant Escherichia coli carrying the colistin resistance gene mcr-1 from German swine farms. J Antimicrob Chemother dkw585.
  10. Hille K, Fischer J, Falgenhauer L, Sharp H, Brenner GM, Kadlec K, Friese A, Schwarz S, Imirzalioglu C, Kietzmann M, Kreienbrock L. 2014. Zum Vorkommen von Extended-Spektrum- und AmpC-Beta-Laktamase-produzierenden Escherichia coli in Nutztierbeständen: Ergebnisse ausgewählter europäischer Studien. Berl Munch Tierarztl Wochenschr 10:403–411.
  11. Imirzalioglu C, Falgenhauer L, Schmiedel J, Waezsada S-E, Gwozdzinski K, Roschanski N, Roesler U, Kreienbrock L, Schiffmann AP, Irrgang A, Kasbohrer A, Bauerfeind R, Domann E, Chakraborty T. 2017. Evaluation of a LAMP-based assay for the rapid detection of plasmid-encoded colistin resistance gene mcr-1 in Enterobacteriaceae isolates. Antimicrob Agents Chemother.
  12. Moremi N, Manda E V, Falgenhauer L, Ghosh H, Imirzalioglu C, Matee M, Chakraborty T, Mshana SE. 2016. Predominance of CTX-M-15 among ESBL producers from environment and fish gut from the shores of Lake Victoria in Mwanza, Tanzania. Front Microbiol 7:1862.
  13. Mshana SE, Falgenhauer L, Mirambo MM, Mushi MF, Moremi N, Julius R, Seni J, Imirzalioglu C, Matee M, Chakraborty T. 2016. Predictors of blaCTX-M-15 in varieties of Escherichia coli genotypes from humans in community settings in Mwanza, Tanzania. BMC Infect Dis 16:187.
  14. Mshana SE, Fritzenwanker M, Falgenhauer L, Domann E, Hain T, Chakraborty T, Imirzalioglu C. 2015. Molecular epidemiology and characterization of an outbreak causing Klebsiella pneumoniae clone carrying chromosomally located blaCTX-M-15 at a German University-Hospital. BMC Microbiol 15:122.
  15. Pietsch M, Eller C, Wendt C, Holfelder M, Falgenhauer L, Fruth A, Grössl T, Leistner R, Valenza G, Werner G, Pfeifer Y. 2015. Molecular characterisation of extended-spectrum β-lactamase (ESBL)-producing Escherichia coli isolates from hospital and ambulatory patients in Germany. Vet Microbiol 200:130–137.
  16. Prieto A, Urcola I, Blanco J, Dahbi G, Muniesa M, Quirós P, Falgenhauer L, Chakraborty T, Hüttener M, Juárez A. 2016. Tracking bacterial virulence: global modulators as indicators. Sci Rep 6:25973.
  17. Roschanski N., Falgenhauer L, Grobbel M, Guenther S, Kreienbrock L, Imirzalioglu C, Roesler U, 2017. Retrospective survey of mcr-1 and mcr-2 in German pig-fattening farms, 2011-2012. Int. J. Antimicrob. Agents. Accepted manuscript.
  18. Schmiedel J, Falgenhauer L, Domann E, Bauerfeind R, Prenger-Berninghoff E, Imirzalioglu C, Chakraborty T. 2014. Multiresistant extended-spectrum β-lactamase-producing Enterobacteriaceae from humans, companion animals and horses in central Hesse, Germany. BMC Microbiol 14:187.
  19. Seni J, Falgenhauer L, Simeo N, Mirambo MM, Imirzalioglu C, Matee M, Rweyemamu M, Chakraborty T, Mshana SE. 2016. Multiple ESBL-producing Escherichia coli sequence types carrying quinolone and aminoglycoside resistance genes circulating in companion and domestic farm animals in Mwanza, Tanzania, harbor commonly occurring plasmids. Front Microbiol 7.
  20. Valentin L, Sharp H, Hille K, Seibt U, Fischer J, Pfeifer Y, Michael GB, Nickel S, Schmiedel J, Falgenhauer L, Friese A, Bauerfeind R, Roesler U, Imirzalioglu C, Chakraborty T, Helmuth R, Valenza G, Werner G, Schwarz S, Guerra B, Appel B, Kreienbrock L, Käsbohrer A. 2014. Subgrouping of ESBL-producing Escherichia coli from animal and human sources: an approach to quantify the distribution of ESBL types between different reservoirs. Int J Med Microbiol 304:805–16.

 

-       Stiftung Tierärztliche Hochschule Hannover (Koordinator)

-       Bundesinstitut für Risikobewertung, Berlin

-       Freie Universität Berlin

-       Friedrich-Loeffler-Institut, Neustadt-Mariensee

-       Justus-Liebig-Universität Gießen

-       Robert-Koch-Institut, Wernigerode

-       Charité – Universitätsmedizin Berlin